在完成工程竣工驗收和初期運營前安全評估的基礎上，經市政府批準，S6號線（寧句城際）、2號線西延線將于2021年12月28日中午12時開通初期運營。屆時，南京地鐵運營里程將由10條線路378公里，增加至11條線路427公里，車站總數由174座增加至191座。
寧句城際：全長43.59公里設13座車站
S6號線（寧句城際）是《南京都市圈發展規劃》批復后首條開通的南京都市圈市域軌道交通線路，它的開通運營將使得南京、鎮江兩地居民開啟軌道上的雙城生活，不僅對打造都市圈“一日生活圈”“一小時通勤圈”有著重要的示范引領作用，同時對寧句同城化、寧鎮揚一體化、南京都市圈以及長三角一體化的發展具有重大促進作用。
S6號線（寧句城際）起于南京東部綜合換乘樞紐馬群站，途徑麒麟、湯山、黃梅、句容北部新城、句容城區，終于句容高鐵站。線路全長43.59km，共設車站13座，其中地下站7座，高架站6座；南京段包括馬群站、百水橋站、麒麟門站、東郊小鎮站、古泉站、南京猿人洞站、湯山站、泉都大街站8座車站，句容段包括黃梅站、童世界站、華陽站、崇明站、句容站5座車站；平均站間距3.633 km，最大站間距7.422km（泉都大街站至黃梅站區間），最小站間距1.285km（百水橋站至麒麟門站區間）。車輛采用市域B型車，列車最高運行速度為120km/h。
融入城市環境
彰顯“縱情山水?回歸自然”設計理念
在車站景觀、內部裝修、乘客設施、便民服務、沿線綠化等建設中，S6號線（寧句城際）充分考慮到與周邊環境和諧相融的要求。例如，古泉站、南京猿人洞站汲取傳統蘇式建筑粉墻黛瓦坡屋頂的元素，用現代建筑材料塑造出有古典韻味的現代車站建筑，形成現代蘇式建筑風格，成功地融入湯山鎮新中式建筑風貌中。
作為跨市域線路，S6號線（寧句城際）分類為“高新科技區、湯山風景區和句容城區”3大特色板塊。地下站利用整體空間主題色與局部的設計變化區分3大特色板塊風格；高架站結合建筑自身特質加以藝術修飾，追求一站一景，內外結合。通過精心設計，為工作繁忙的市民提供一條集休閑、放松、生態、文化藝術于一身的線路，形成“縱情山水?回歸自然”的設計主題。
快車單趟運營時間約為35分鐘
S6號線（寧句城際）開通初期首班車雙向自馬群站、句容站6:00對發，末班車句容站22:00發車、馬群站22:30發車，快車單程運營時間約35分鐘，常規列車約40分鐘。早高峰采用單向加密方式，句容站至馬群站方向最小行車間隔8分鐘，平峰間隔11分30秒，晚高峰行車間隔9分12秒。為進一步提高通行效率，9:00-16:00馬群站、句容站每個整點均組織快車對發，每日共開行8對，快車在古泉站、南京猿人洞站、湯山站、童世界站和華陽站不停站通過。為方便乘客出行，南京地鐵官方微博將公布相關運營信息，同時各車站也將做好對外公告，請乘客留意并提前規劃出行安排。后續南京地鐵將根據實際客流情況，逐步調整并優化運力，不斷提高服務水平。
南京地鐵目前實行按里程分段計價票制：起步價2元可乘4公里，4公里以上部分，每增加1元的晉級里程為5、5、7、7、9、11、13、15公里。S6號線（寧句城際）開通初期運營后，乘客從句容站乘坐地鐵換乘2號線至新街口站票價9元。
為充分體現軌道交通的人性化設計，保證乘客的乘用感受，S6號線（寧句城際）注重提升衛生間設計標準，全線增設第三衛生間以及母嬰室。衛生間設計著重細節打造，對廁位、洗手盆、小便斗、化妝臺、第三衛生間等細節進行了提升優化；全線車站均設置母嬰室，內設空調系統。
開創“跨市域協同執法”新模式
面對跨市域列車運營的同城化管理問題，南京市地鐵交通設施保護辦公室（以下簡稱地保辦）堅持多措并舉，積極探索跨市域協同執法的新模式，從法治保障、執法協同、應急聯動以及信息共享等方面，創新跨市域軌道交通協同治理體系，為寧句城際開通運營提供了堅實的法治保障。12月15日，南京與鎮江兩市人大常委會共同舉行《關于跨市域軌道交通運營和執法管理若干問題的決定》頒布實施新聞發布會，該《決定》的頒布實施為寧句城際開通運營及時提供了法治保障，實現了列車車廂內的執法主體、執法事項和執法尺度的統一。寧句城際開通后，地保辦將全面推進《決定》的實施，落實普法責任制，擴大普法受眾面，聯合句容市相關單位，舉辦多樣化多形式活動，讓老百姓知曉文明乘車規定，使文明乘車成為乘客自覺行動。
2號線西延線：全長5.4公里設4座車站
2號線西延線西起魚嘴地區，沿秦新路向東敷設，分別在頭關街路口設起點站魚嘴站，在天保街路口設天保街站，在青蓮街路口設青蓮街站，在永初路路口設螺塘路站，穿越繞城高速后向北轉入蓮花路南側，下穿平良大街后與已運營2號線油坊橋站連通。線路全長5.4km，其中地面段0.2km，地下段5.2km，共新設車站4座，均為地下站，平均站間距為1.37km。車輛選型采用A型6輛編組，列車最高運行速度為80km/h。
運營服務時間為6:00-23:00
2號線（含西延線）運營服務時間為6:00-23:00，最小行車間隔2分30秒。為方便乘客早間出行，2號線在目前“多站首班車”方案的基礎上，往魚嘴方向增設2列首班載客車，6:00自集慶門大街站、上海路站發出，該方向部分車站的首班車時間較目前提前10-20分鐘。南京地鐵官方微博將公布相關運營信息，同時各車站也將做好對外公告，請乘客留意并提前規劃出行安排。后續南京地鐵將視情逐步調整并優化運力，不斷提高服務水平。
S6號線（寧句城際）、2號線西延線開通初期運營后，在運營服務方面可能會存在一些不足，市民如有問題和建議請撥打地鐵服務熱線（025）51899999反映，南京地鐵將及時做好各項服務工作。
